Die Gesund­heits­politik liegt grund­sätz­lich in der Ver­ant­wor­tung der einzelnen EU-Mitglied­staaten, während der euro­pä­ische Binnen­markt gemein­same Regeln für Waren und Dienst­leistungen vor­gibt. Für Apotheken ent­steht daraus ein Span­nungs­feld zwischen nationalen Schutz­vor­gaben und euro­päischen Markt­interessen.

Die ABDA vertritt die Interessen der deutschen Apo­theker­schaft in Brüssel, im Bundes­verband der Freien Berufe (BFB) sowie im Zusammen­schluss der Apotheker in der Euro­päischen Union (ZAEU/PGEU). Zugleich bringt sie die Posi­tionen der deu­tschen Apotheker­schaft in euro­päische Gesetz­gebungs­verfahren ein und begleitet zentrale Vorhaben wie das EU-Pharma­paket zur Reform des euro­päischen Arznei­mittel­rechts.